W 1924 r. gmina synagogalna rozbudowała dom przedpogrzebowy. W latach 1926-1928 w sąsiedztwie cmentarza wzniesiono gmach mieszczący siedzibę władz prowincji. W latach 1932-133 przewodniczącym Komisji Cmentarnej w Gminie Synagogalnej był Joseph Lewin. Pogrzebami zajmowały się: Związek Chewra Kadisza - Pielęgnacja Chorych i Pogrzeby pod przewodnictwem Maxa Simonsohna oraz Izraelicki Związek Pogrzebowy.

31 maja 1939 r. na cmentarzu odbył się ostatni znany pogrzeb - pochowano wtedy dr Herthe Wohl z domu Goetze. Brak szczegółowych danych o procesie niszczenia cmentarza. Według Petera Simonsteina Cullmana obiekt w czasie drugiej wojny światowej został splantowany i przekształcony na park (na planie miasta z 1944 r. był wciąż zaznaczony jako cmentarz).

W sporządzonym przez Prezydium Wojewódzkiej Rady Narodowej w 1953 r. dokumencie "Charakterystyka zniszczeń cmentarzy poewangelickich i pożydowskich" odnotowano: "Nie ma cmentarza pożydowskiego". W 1954 r. część cmentarza znalazła się na terenie Szkoły Podoficerskiej Milicji Obywatelskiej, która zajęła dawną siedzibę władz prowincji. W jego obrębie zbudowano przedszkole i salę gimnastyczną.

W 2013 r. na zlecenie Szkoły Policji na terenie cmentarza rozpoczęto prace budowlane, w trakcie których wykopano kości, macewy i ich fragmenty, kłódki, żeliwne części ogrodzeń grobów. Po negocjacjach z przedstawicielami Związku Gmin Wyznaniowych Żydowskich w RP Szkoła Policji w Pile otrzymała zgodę na rozbudowę placówki i zobowiązała się do ufundowania pomnika na cmentarzu. 2 czerwca 2015 r. na skraju cmentarza odsłonięto zaprojektowany przez Janusza Marciniaka pomnik w formie granitowej, poziomej gwiazdy Dawida umocowanej na stalowej konstrukcji na betonowej wylewce na planie sześcioramiennej gwiazdy. Na pomniku wyryto napis w językach polskim, angielskim i hebrajskim: "Stoisz na założonym w XVII wieku cmentarzu żydowskim, który został zniszczony przez nazistów niemieckich podczas II wojny światowej. I wróci proch do ziemi, tak jak nią był, a duch wróci do Boga, który go dał. Koh 12, 7. Jak pamiętamy, tak będziemy pamiętani. Pomnik został ufundowany przez Gminę Piła i Szkołę Policji w Pile". Na pobliskim murze umieszczono tablicę informacyjną. Wykopane podczas prac budowlanych nagrobki, kłódki i metalowe elementy przejęło Muzeum Okręgowe im. Stanisława Staszica w Pile.

W wyniku zniszczeń z naziemnej warstwy cmentarza zachował się fragment ceglanego muru cmentarza i aleja wiązów. Brak nagrobków, granice cmentarza są nieczytelne. Obiekt nie jest wpisany do rejestru zabytków nieruchomych województwa wielkopolskiego, posiada wpisy w gminnej i wojewódzkiej ewidencji zabytków.

Zamiar wejścia na cmentarz należy z wyprzedzeniem uzgodnić z dyżurnym Szkoły Policji w Pile (tel. 47 774 24 02).